289 Acacia dealbata

289.1 Données d’occurrences GBIF

Collecte des données du GBIF :

<<gbif download metadata>>
  Status: SUCCEEDED
  DOI: 10.15468/dl.2zr9hn
  Format: SIMPLE_CSV
  Download key: 0018309-230828120925497
  Created: 2023-09-16T09:32:24.200+00:00
  Modified: 2023-09-16T09:33:29.946+00:00
  Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0018309-230828120925497.zip
  Total records: 28807

Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du tableau) :

Simple feature collection with 28807 features and 50 fields
Attribute-geometry relationships: constant (50)
Geometry type: POINT
Dimension:     XY
Bounding box:  xmin: -124.4996 ymin: -46.56001 xmax: 176.8936 ymax: 63.434
Geodetic CRS:  WGS 84
# A tibble: 28,807 × 51
      gbifID datasetKey     occurrenceID kingdom phylum class order family genus
 *   <int64> <chr>          <chr>        <chr>   <chr>  <chr> <chr> <chr>  <chr>
 1 932708606 ebd49d9b-696b… ""           Plantae Trach… Magn… Faba… Fabac… Acac…
 2 932707530 ebd49d9b-696b… ""           Plantae Trach… Magn… Faba… Fabac… Acac…
 3 932707384 ebd49d9b-696b… ""           Plantae Trach… Magn… Faba… Fabac… Acac…
 4 932706239 ebd49d9b-696b… ""           Plantae Trach… Magn… Faba… Fabac… Acac…
 5 932706215 ebd49d9b-696b… ""           Plantae Trach… Magn… Faba… Fabac… Acac…
 6 932705993 ebd49d9b-696b… ""           Plantae Trach… Magn… Faba… Fabac… Acac…
 7 932705661 ebd49d9b-696b… ""           Plantae Trach… Magn… Faba… Fabac… Acac…
 8 932705595 ebd49d9b-696b… ""           Plantae Trach… Magn… Faba… Fabac… Acac…
 9 920208229 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Faba… Fabac… Acac…
10 920204015 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Faba… Fabac… Acac…
# ℹ 28,797 more rows
# ℹ 42 more variables: species <chr>, infraspecificEpithet <chr>,
#   taxonRank <chr>, scientificName <chr>, verbatimScientificName <chr>,
#   verbatimScientificNameAuthorship <chr>, countryCode <chr>, locality <chr>,
#   stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>, individualCount <int>,
#   publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>, decimalLongitude <dbl>,
#   coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>, …

Il y a 28 807 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :

Figure 289.1: Occurrences de Acacia dealbata dans le monde.

289.1.1 Données par région

On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.

[1] 0.4565904

[1] 0.01034471

[1] 0.0007289895

Espèce non endémique