198 Cinnamomum camphora
198.1 Données d’occurrences GBIF
Collecte des données du GBIF :
<<gbif download metadata>>
Status: SUCCEEDED
DOI: 10.15468/dl.5uh9xh
Format: SIMPLE_CSV
Download key: 0260802-230224095556074
Created: 2023-05-25T10:22:13.450+00:00
Modified: 2023-05-25T10:23:04.720+00:00
Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0260802-230224095556074.zip
Total records: 7727Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et
exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du
tableau) :
Simple feature collection with 7727 features and 50 fields
Attribute-geometry relationship: 50 constant, 0 aggregate, 0 identity
Geometry type: POINT
Dimension: XY
Bounding box: xmin: -159.77055 ymin: -39.503728 xmax: 176.855312 ymax: 63.434
Geodetic CRS: WGS 84
# A tibble: 7,727 × 51
gbifID datasetKey occurrenceID kingdom phylum class order family genus species
* <int64> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr>
1 3117962094 5f06e39d-81cf-46… "USFS - New… Plantae Trach… Magn… Laur… Laura… Cinn… Cinnam…
2 3117941068 5f06e39d-81cf-46… "USFS - New… Plantae Trach… Magn… Laur… Laura… Cinn… Cinnam…
3 3117594062 5f06e39d-81cf-46… "USFS - New… Plantae Trach… Magn… Laur… Laura… Cinn… Cinnam…
4 925148081 cd6e21c8-9e8a-49… "http://spe… Plantae Trach… Magn… Laur… Laura… Cinn… Cinnam…
5 921133876 6ac3f774-d9fb-47… "" Plantae Trach… Magn… Laur… Laura… Cinn… Cinnam…
6 921125166 6ac3f774-d9fb-47… "" Plantae Trach… Magn… Laur… Laura… Cinn… Cinnam…
7 921110688 6ac3f774-d9fb-47… "" Plantae Trach… Magn… Laur… Laura… Cinn… Cinnam…
8 912567833 cd6e21c8-9e8a-49… "http://spe… Plantae Trach… Magn… Laur… Laura… Cinn… Cinnam…
9 912567673 cd6e21c8-9e8a-49… "http://spe… Plantae Trach… Magn… Laur… Laura… Cinn… Cinnam…
10 891595772 29d56be4-2b76-4a… "TAI228101" Plantae Trach… Magn… Laur… Laura… Cinn… Cinnam…
# ℹ 7,717 more rows
# ℹ 41 more variables: infraspecificEpithet <chr>, taxonRank <chr>, scientificName <chr>,
# verbatimScientificName <chr>, verbatimScientificNameAuthorship <chr>,
# countryCode <chr>, locality <chr>, stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>,
# individualCount <int>, publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>,
# decimalLongitude <dbl>, coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>,
# elevation <dbl>, elevationAccuracy <dbl>, depth <lgl>, depthAccuracy <lgl>, …Il y a 7 727 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :
Figure 198.1: Occurrences de Cinnamomum camphora dans le monde.
198.1.1 Données par région
On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.
[1] 0.001811828653[1] 0.09615633493[1] 0.1648764074Espèce non endémique