274 Quercus velutina

274.1 Données d’occurrences GBIF

Collecte des données du GBIF :

<<gbif download metadata>>
  Status: SUCCEEDED
  DOI: 10.15468/dl.2xg2yk
  Format: SIMPLE_CSV
  Download key: 0018182-230828120925497
  Created: 2023-09-15T23:59:52.221+00:00
  Modified: 2023-09-16T00:00:37.435+00:00
  Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0018182-230828120925497.zip
  Total records: 4162

Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du tableau) :

Simple feature collection with 2914 features and 50 fields
Attribute-geometry relationships: constant (50)
Geometry type: POINT
Dimension:     XY
Bounding box:  xmin: -121.8 ymin: -38.56258 xmax: 177.7151 ymax: 53.35654
Geodetic CRS:  WGS 84
# A tibble: 2,914 × 51
       gbifID datasetKey    occurrenceID kingdom phylum class order family genus
 *    <int64> <chr>         <chr>        <chr>   <chr>  <chr> <chr> <chr>  <chr>
 1 3393668495 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 2 3393441948 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 3 3393769380 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 4 3393457207 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 5 3393682255 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 6 3393415193 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 7 3393469946 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 8 3393559864 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 9 3393530473 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
10 3393759442 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
# ℹ 2,904 more rows
# ℹ 42 more variables: species <chr>, infraspecificEpithet <lgl>,
#   taxonRank <chr>, scientificName <chr>, verbatimScientificName <chr>,
#   verbatimScientificNameAuthorship <chr>, countryCode <chr>, locality <chr>,
#   stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>, individualCount <int>,
#   publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>, decimalLongitude <dbl>,
#   coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <lgl>, …

Il y a 2 914 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :

Occurrences de Quercus velutina dans le monde.

Figure 274.1: Occurrences de Quercus velutina dans le monde.

274.1.1 Données par région

On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.

[1] 0.05044612
[1] 0.947838
[1] 0

Espèce endémique d’Amérique du Nord

Occurrence de Quercus velutina dans la région d'endémisme.

Figure 274.2: Occurrence de Quercus velutina dans la région d’endémisme.

274.1.2 Licences

On s’intéresse ici au problème particulier des licences :


   CC_BY_4_0 CC_BY_NC_4_0      CC0_1_0 
         388         1873          501 
[1] 32.18682
Occurrence de Quercus velutina dans la région d'endémisme, selon la licence : CC BY-NC en bleu ; CC0 et CC BY en orange.

Figure 274.3: Occurrence de Quercus velutina dans la région d’endémisme, selon la licence : CC BY-NC en bleu ; CC0 et CC BY en orange.

Idéalement, on aimerait avoir au moins 50 % de données vraiment libres d’utilisation (c’est-à-dire sans la clause -NC). On continue en supprimant les données en CC BY-NC.

Moins de 50 % de données librement utilisables

[1] 889

274.1.3 Sous-échantillonnage

Si le jeu de données contient 25 000 occurrences ou plus, on procède au sous-échantillonnage aléatoire pour en conserver un maximum de 25 000.

Moins de 25 000 occurrences : pas de sous-échantillonnage

Simple feature collection with 889 features and 50 fields
Attribute-geometry relationships: constant (50)
Geometry type: POINT
Dimension:     XY
Bounding box:  xmin: -105 ymin: 30.25853 xmax: -69.95842 ymax: 45.34347
Geodetic CRS:  WGS 84
# A tibble: 889 × 51
       gbifID datasetKey    occurrenceID kingdom phylum class order family genus
      <int64> <chr>         <chr>        <chr>   <chr>  <chr> <chr> <chr>  <chr>
 1 3393668495 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 2 3393441948 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 3 3393769380 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 4 3393457207 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 5 3393682255 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 6 3393415193 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 7 3393469946 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 8 3393559864 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
 9 3393530473 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
10 3393759442 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Quer…
# ℹ 879 more rows
# ℹ 42 more variables: species <chr>, infraspecificEpithet <lgl>,
#   taxonRank <chr>, scientificName <chr>, verbatimScientificName <chr>,
#   verbatimScientificNameAuthorship <chr>, countryCode <chr>, locality <chr>,
#   stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>, individualCount <int>,
#   publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>, decimalLongitude <dbl>,
#   coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <lgl>, …

274.1.4 Carte finale

On prépare la carte finale des occurrences :

Occurrence de Quercus velutina dans la région d'endémisme après sous-échantillonnage éventuel.

Figure 274.4: Occurrence de Quercus velutina dans la région d’endémisme après sous-échantillonnage éventuel.

274.2 Modélisation de la niche climatique

274.2.1 Préparer les données

Organisation des données d’entrées (occurrences et données environnementales) et des données produites de pseudo-absences :

 class       : SpatVector 
 geometry    : points 
 dimensions  : 889, 0  (geometries, attributes)
 extent      : -105, -69.95842, 30.25853, 45.34347  (xmin, xmax, ymin, ymax)
 coord. ref. : lon/lat WGS 84 (EPSG:4326) 

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= quve Data Formating -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

      ! Response variable is considered as only presences... Is it really what you want?
      ! No data has been set aside for modeling evaluation
 !!! Some data are located in the same raster cell. 
          Please set `filter.raster = TRUE` if you want an automatic filtering.

Checking Pseudo-absence selection arguments...

   > random pseudo absences selection
   > Pseudo absences are selected in explanatory variables
 ! Some NAs have been automatically removed from your data
 !!! Some data are located in the same raster cell. 
          Please set `filter.raster = TRUE` if you want an automatic filtering.
-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= Done -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= BIOMOD.formated.data -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

dir.name =  Output

sp.name =  quve

     885 presences,  0 true absences and  2661 undefined points in dataset


     6 explanatory variables

 temp_max_august     temp_min       temp_wet_quart    temp_season     
 Min.   : 5.567   Min.   :-30.596   Min.   :-9.678   Min.   :  56.55  
 1st Qu.:24.336   1st Qu.:-14.533   1st Qu.:11.245   1st Qu.: 769.10  
 Median :27.782   Median : -7.970   Median :16.973   Median : 899.11  
 Mean   :27.459   Mean   : -8.247   Mean   :15.800   Mean   : 886.85  
 3rd Qu.:31.184   3rd Qu.: -2.694   3rd Qu.:21.184   3rd Qu.:1053.50  
 Max.   :42.960   Max.   : 23.500   Max.   :32.661   Max.   :1457.65  
 prec_wet_quart    prec_season     
 Min.   :  28.0   Min.   :  5.523  
 1st Qu.: 229.0   1st Qu.: 17.344  
 Median : 299.0   Median : 31.740  
 Mean   : 313.6   Mean   : 38.352  
 3rd Qu.: 344.0   3rd Qu.: 55.345  
 Max.   :1788.0   Max.   :133.646  

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

On visualise les pseudo-absences :

Les données d'occurrences (en haut à gauche) et les trois jeux de données aléatoires de pseudo-absences.

Figure 274.5: Les données d’occurrences (en haut à gauche) et les trois jeux de données aléatoires de pseudo-absences.

$data.vect
 class       : SpatVector 
 geometry    : points 
 dimensions  : 6207, 2  (geometries, attributes)
 extent      : -129.6875, -52.72917, 13.0625, 54.97917  (xmin, xmax, ymin, ymax)
 coord. ref. :  
 names       :  resp         dataset
 type        : <num>           <chr>
 values      :    10 Initial dataset
                  10 Initial dataset
                  10 Initial dataset

$data.label
                              9                              10 
                "**Presences**"       "Presences (calibration)" 
                             11                              12 
       "Presences (validation)"        "Presences (evaluation)" 
                             19                              20 
            "**True Absences**"   "True Absences (calibration)" 
                             21                              22 
   "True Absences (validation)"    "True Absences (evaluation)" 
                             29                              30 
          "**Pseudo-Absences**" "Pseudo-Absences (calibration)" 
                             31                               1 
 "Pseudo-Absences (validation)"                    "Background" 

$data.plot
Les données d'occurrences (en haut à gauche) et les trois jeux de données aléatoires de pseudo-absences.

Figure 274.6: Les données d’occurrences (en haut à gauche) et les trois jeux de données aléatoires de pseudo-absences.

274.2.2 Modèles individuels de niche


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= Build Single Models -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=


Checking Models arguments...

Creating suitable Workdir...

            ! Weights where automatically defined for quve_PA1 to rise a 0.5 prevalence !
            ! Weights where automatically defined for quve_PA2 to rise a 0.5 prevalence !
            ! Weights where automatically defined for quve_PA3 to rise a 0.5 prevalence !


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= quve Modeling Summary -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

 6  environmental variables ( temp_max_august temp_min temp_wet_quart temp_season prec_wet_quart prec_season )
Number of evaluation repetitions : 1
Models selected : GAM MARS MAXNET GBM ANN RF 

Total number of model runs: 18 

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=


-=-=-=- Run :  quve_PA1 


-=-=-=--=-=-=- quve_PA1_RUN1 


-=-=-=- Run :  quve_PA2 


-=-=-=--=-=-=- quve_PA2_RUN1 


-=-=-=- Run :  quve_PA3 


-=-=-=--=-=-=- quve_PA3_RUN1 

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= Done -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

274.2.2.1 Évaluation de la performance

             full.name  PA  run   algo metric.eval cutoff sensitivity
1    quve_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1    GAM         TSS    606      98.446
2    quve_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1    GAM         ROC    608      98.446
3   quve_PA1_RUN1_MARS PA1 RUN1   MARS         TSS    461      95.904
4   quve_PA1_RUN1_MARS PA1 RUN1   MARS         ROC    466      95.904
5 quve_PA1_RUN1_MAXNET PA1 RUN1 MAXNET         TSS    364      94.774
6 quve_PA1_RUN1_MAXNET PA1 RUN1 MAXNET         ROC    361      95.056
  specificity calibration validation evaluation
1      74.121       0.727      0.741         NA
2      74.262       0.827      0.825         NA
3      80.872       0.768      0.815         NA
4      81.153       0.950      0.967         NA
5      82.419       0.773      0.820         NA
6      82.419       0.948      0.968         NA
Évaluation de la performance des modèles individuels : True Skill Statistic & aire sous la courbe de ROC.

Figure 274.7: Évaluation de la performance des modèles individuels : True Skill Statistic & aire sous la courbe de ROC.

274.2.2.2 Importance des variables environnementales

          full.name  PA  run algo        expl.var rand  var.imp
1 quve_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1  GAM temp_max_august    1 0.217794
2 quve_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1  GAM        temp_min    1 0.421569
3 quve_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1  GAM  temp_wet_quart    1 0.006830
4 quve_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1  GAM     temp_season    1 0.122993
5 quve_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1  GAM  prec_wet_quart    1 0.086471
6 quve_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1  GAM     prec_season    1 0.519847
Pourcentage de variance expliquée pour chaque variable, décomposé par algorithme.

Figure 274.8: Pourcentage de variance expliquée pour chaque variable, décomposé par algorithme.

Pourcentage de variance expliquée pour chaque variable, décomposé par variable.

Figure 274.9: Pourcentage de variance expliquée pour chaque variable, décomposé par variable.

274.2.2.3 Courbes de réponses

Courbes de réponse de chaque variable climatique selon l'algorithme (en couleurs).

Figure 274.10: Courbes de réponse de chaque variable climatique selon l’algorithme (en couleurs).

274.2.3 Modèles d’ensemble de niche

Seulement modèles avec TSS > 0.8


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= BIOMOD.ensemble.models.out -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

sp.name : quve

expl.var.names : temp_max_august temp_min temp_wet_quart temp_season 
prec_wet_quart prec_season


models computed: 
quve_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo, quve_EMwmeanByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo

models failed: none

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

274.2.3.1 Évaluation de la qualité

                                          full.name merged.by.PA merged.by.run
1 quve_EMwmeanByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
2 quve_EMwmeanByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
  merged.by.algo filtered.by    algo metric.eval cutoff sensitivity specificity
1     mergedAlgo         TSS EMwmean         TSS  498.0      97.288      87.298
2     mergedAlgo         TSS EMwmean         ROC  499.5      97.175      87.599
  calibration validation evaluation
1       0.847         NA         NA
2       0.980         NA         NA
Évaluation de la qualité du modèle d'ensemble : Aire sous la courbe de ROC & True Skill Statistic.

Figure 274.11: Évaluation de la qualité du modèle d’ensemble : Aire sous la courbe de ROC & True Skill Statistic.

                                       full.name merged.by.PA merged.by.run
1 quve_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
2 quve_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
3 quve_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
4 quve_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
5 quve_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
6 quve_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
  merged.by.algo filtered.by algo        expl.var rand  var.imp
1     mergedAlgo         TSS EMcv temp_max_august    1 0.200534
2     mergedAlgo         TSS EMcv        temp_min    1 0.308734
3     mergedAlgo         TSS EMcv  temp_wet_quart    1 0.036200
4     mergedAlgo         TSS EMcv     temp_season    1 0.096038
5     mergedAlgo         TSS EMcv  prec_wet_quart    1 0.122159
6     mergedAlgo         TSS EMcv     prec_season    1 0.298634

Par variable :

Pourcentage de variance expliquée par variable dans le modèle d'ensemble.

Figure 274.12: Pourcentage de variance expliquée par variable dans le modèle d’ensemble.

Courbes de réponse de chaque variable climatique dans le modèle d'ensemble.

Figure 274.13: Courbes de réponse de chaque variable climatique dans le modèle d’ensemble.

274.3 Projections

274.3.1 Distribution potentielle contemporaine

Contemporaine : Cartographie des observations sur couches climatiques Extraction des conditions climatiques favorables


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= BIOMOD.projection.out -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

Projection directory : Output/quve/current


sp.name : quve

expl.var.names : temp_max_august temp_min temp_wet_quart temp_season 
prec_wet_quart prec_season


modeling.id : AllModels ( Output/quve/quve.AllModels.models.out )

models.projected : 
quve_PA1_RUN1_GAM, quve_PA1_RUN1_MARS, quve_PA1_RUN1_MAXNET, quve_PA1_RUN1_GBM, quve_PA1_RUN1_RF, quve_PA2_RUN1_GAM, quve_PA2_RUN1_MARS, quve_PA2_RUN1_MAXNET, quve_PA2_RUN1_GBM, quve_PA2_RUN1_RF, quve_PA3_RUN1_GAM, quve_PA3_RUN1_MARS, quve_PA3_RUN1_MAXNET, quve_PA3_RUN1_GBM, quve_PA3_RUN1_RF

available binary projection : TSS, ROC

available filtered projection : TSS, ROC

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=
Projection de la distribution potentielle contemporaine sur l'Europe, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.

Figure 274.14: Projection de la distribution potentielle contemporaine sur l’Europe, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.

Projection de la distribution potentielle contemporaine sur l'Europe, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.

Figure 274.15: Projection de la distribution potentielle contemporaine sur l’Europe, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= BIOMOD.projection.out -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

Projection directory : Output/quve/current


sp.name : quve

expl.var.names : temp_max_august temp_min temp_wet_quart temp_season 
prec_wet_quart prec_season


modeling.id : AllModels ( Output/quve/quve.AllModels.ensemble.models.out )

models.projected : 
quve_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo, quve_EMwmeanByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=
A) Projection de la distribution potentielle contemporaine (modèle d'ensemble) ; B) Incertitude associée à la projection.

Figure 274.16: A) Projection de la distribution potentielle contemporaine (modèle d’ensemble) ; B) Incertitude associée à la projection.

274.3.2 Interpolation à l’échelle de la métropole

  • → conditions climatiques favorables à fine échelle

On projette la niche climatique sur ce raster à fine échelle.


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= BIOMOD.projection.out -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

Projection directory : Output/quve/cont_gre


sp.name : quve

expl.var.names : temp_max_august temp_min temp_wet_quart temp_season 
prec_wet_quart prec_season


modeling.id : AllModels ( Output/quve/quve.AllModels.models.out )

models.projected : 
quve_PA1_RUN1_GAM, quve_PA1_RUN1_MARS, quve_PA1_RUN1_MAXNET, quve_PA1_RUN1_GBM, quve_PA1_RUN1_RF, quve_PA2_RUN1_GAM, quve_PA2_RUN1_MARS, quve_PA2_RUN1_MAXNET, quve_PA2_RUN1_GBM, quve_PA2_RUN1_RF, quve_PA3_RUN1_GAM, quve_PA3_RUN1_MARS, quve_PA3_RUN1_MAXNET, quve_PA3_RUN1_GBM, quve_PA3_RUN1_RF

available binary projection : TSS, ROC

available filtered projection : TSS, ROC

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=
Projection de la distribution potentielle contemporaine sur la métropole de Grenoble, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.

Figure 274.17: Projection de la distribution potentielle contemporaine sur la métropole de Grenoble, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.

Projection de la distribution potentielle contemporaine sur la métropole de Grenoble, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.

Figure 274.18: Projection de la distribution potentielle contemporaine sur la métropole de Grenoble, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= BIOMOD.projection.out -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

Projection directory : Output/quve/cont_gre


sp.name : quve

expl.var.names : temp_max_august temp_min temp_wet_quart temp_season 
prec_wet_quart prec_season


modeling.id : AllModels ( Output/quve/quve.AllModels.ensemble.models.out )

models.projected : 
quve_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo, quve_EMwmeanByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=
A) Projection de la distribution potentielle contemporaine (modèle d'ensemble) sur la métropole de Grenoble ; B) Incertitude associée à la projection.

Figure 274.19: A) Projection de la distribution potentielle contemporaine (modèle d’ensemble) sur la métropole de Grenoble ; B) Incertitude associée à la projection.

274.3.3 Distributions potentielles futures

Futur : Projection à l’échelle de l’Europe jusqu’à l’horizon 2100

Toutes les fenêtres temporelles × scénarios pour le GCM « IPSL-CM6A-LR »

  1. SSP1-2.6
Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP1-2.6 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP1-2.6 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP1-2.6 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP1-2.6 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP1-2.6 (modèle d'ensemble).

Figure 274.20: Projection des distributions potentielles futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP1-2.6 (modèle d’ensemble).

On obtient pour la métrique TSS une carte unique de moyenne pondérée sur les algorithmes et sur les jeux de pseudo-absences.

  1. SSP2-4.5
Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP2-4.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP2-4.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP2-4.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP2-4.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP2-4.5 (modèle d'ensemble).

Figure 274.21: Projection des distributions potentielles futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP2-4.5 (modèle d’ensemble).

  1. SSP3-7.0
Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP3-7.0 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP3-7.0 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP3-7.0 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP3-7.0 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP3-7.0 (modèle d'ensemble).

Figure 274.22: Projection des distributions potentielles futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP3-7.0 (modèle d’ensemble).

  1. SSP5-8.5
Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble).

Figure 274.23: Projection des distributions potentielles futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d’ensemble).

274.4 Inférence à l’échelle de la métropole

  • Croisement avec températures de surface 2019 (fournie par la métropole)
  • → conditions climatiques favorables à fine échelle
  • à peu près 7 pixels × 9 (WorldClim)

274.4.1 Distributions potentielles futures

Même chose que précédemment mais sur les rasters de Grenoble

  1. SSP1-2.6
Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).

Figure 274.24: Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d’ensemble, GCM IPSL).

  1. SSP2-4.5
Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).

Figure 274.25: Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d’ensemble, GCM IPSL).

  1. SSP3-7.0
Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).

Figure 274.26: Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d’ensemble, GCM IPSL).

  1. SSP5-8.5
Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).

Figure 274.27: Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d’ensemble, GCM IPSL).

274.4.2 Évolution temporelle

# A tibble: 17 × 8
   min         q1          median      mean        q3          max   ssp    year
   <table[1d]> <table[1d]> <table[1d]> <table[1d]> <table[1d]> <tab> <fct> <dbl>
 1 138         200         274         320.2229    429         682   0      2000
 2 157         337         447         440.0365    541         704   126    2040
 3 146         368         483         468.2192    574         669   126    2060
 4 134         351         464         451.2408    550         658   126    2080
 5 135         365         485         469.5633    574         668   126    2100
 6 182         363         473         463.1560    566         702   245    2040
 7 157         384         500         480.0876    579         661   245    2060
 8 194         396         522         492.1498    592         668   245    2080
 9 217         379         512         478.8271    567         655   245    2100
10 156         349         459         450.5067    553         706   370    2040
11 154         399         511         493.6461    592         672   370    2060
12 214         373         511         481.3012    575         682   370    2080
13 148         310         454         410.1149    506         610   370    2100
14 131         316         435         421.5920    524         662   585    2040
15 190         413         527         497.8949    595         669   585    2060
16 165         333         482         430.4364    517         628   585    2080
17 147         274         372         355.5816    426         536   585    2100
Évolution de la favorabilité climatique au cours du XXIème siècle. Le point représente la médiane sur l'étendue de la métropole (i.e. tous les pixels de la carte) ; le trait gras représente 50 % des données intermédiaires (espace inter-quartile) ; le trait fin représente le reste des données du minimum au maximum.

Figure 274.28: Évolution de la favorabilité climatique au cours du XXIème siècle. Le point représente la médiane sur l’étendue de la métropole (i.e. tous les pixels de la carte) ; le trait gras représente 50 % des données intermédiaires (espace inter-quartile) ; le trait fin représente le reste des données du minimum au maximum.