302 Metrosideros excelsa

302.1 Données d’occurrences GBIF

Collecte des données du GBIF :

<<gbif download metadata>>
  Status: SUCCEEDED
  DOI: 10.15468/dl.efk2ze
  Format: SIMPLE_CSV
  Download key: 0018461-230828120925497
  Created: 2023-09-16T14:33:38.490+00:00
  Modified: 2023-09-16T14:34:18.345+00:00
  Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0018461-230828120925497.zip
  Total records: 1470

Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du tableau) :

Simple feature collection with 1470 features and 50 fields
Attribute-geometry relationships: constant (50)
Geometry type: POINT
Dimension:     XY
Bounding box:  xmin: -176.5627 ymin: -46.90127 xmax: 178.3694 ymax: 63.434
Geodetic CRS:  WGS 84
# A tibble: 1,470 × 51
      gbifID datasetKey     occurrenceID kingdom phylum class order family genus
 *   <int64> <chr>          <chr>        <chr>   <chr>  <chr> <chr> <chr>  <chr>
 1 922318084 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Metr…
 2 922316818 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Metr…
 3 922312375 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Metr…
 4 922306894 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Metr…
 5 922304154 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Metr…
 6 922300439 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Metr…
 7 922297831 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Metr…
 8 922296512 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Metr…
 9 922294893 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Metr…
10 922294477 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Metr…
# ℹ 1,460 more rows
# ℹ 42 more variables: species <chr>, infraspecificEpithet <lgl>,
#   taxonRank <chr>, scientificName <chr>, verbatimScientificName <chr>,
#   verbatimScientificNameAuthorship <chr>, countryCode <chr>, locality <chr>,
#   stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>, individualCount <int>,
#   publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>, decimalLongitude <dbl>,
#   coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>, …

Il y a 1 470 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :

Figure 302.1: Occurrences de Metrosideros excelsa dans le monde.

302.1.1 Données par région

On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.

[1] 0.01360544

[1] 0.008843537

[1] 0

Espèce non endémique