228 Schinus molle

228.1 Données d’occurrences GBIF

Collecte des données du GBIF :

<<gbif download metadata>>
  Status: SUCCEEDED
  DOI: 10.15468/dl.8r9jax
  Format: SIMPLE_CSV
  Download key: 0260978-230224095556074
  Created: 2023-05-25T13:08:08.258+00:00
  Modified: 2023-05-25T13:09:03.364+00:00
  Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0260978-230224095556074.zip
  Total records: 9166

Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du tableau) :

Simple feature collection with 9166 features and 50 fields
Attribute-geometry relationship: 50 constant, 0 aggregate, 0 identity
Geometry type: POINT
Dimension:     XY
Bounding box:  xmin: -159.63 ymin: -43.6593 xmax: 176.901984 ymax: 46.131677
Geodetic CRS:  WGS 84
# A tibble: 9,166 × 51
      gbifID datasetKey         occurrenceID kingdom phylum class order family genus species
 *   <int64> <chr>              <chr>        <chr>   <chr>  <chr> <chr> <chr>  <chr> <chr>  
 1 911796782 85714c48-f762-11e… https://her… Plantae Trach… Magn… Sapi… Anaca… Schi… Schinu…
 2 910472194 837acfc2-f762-11e… HSS:HSS:277… Plantae Trach… Magn… Sapi… Anaca… Schi… Schinu…
 3 910456961 837acfc2-f762-11e… HSS:HSS:436… Plantae Trach… Magn… Sapi… Anaca… Schi… Schinu…
 4 899978299 50c9509d-22c7-4a2… http://www.… Plantae Trach… Magn… Sapi… Anaca… Schi… Schinu…
 5 899966770 50c9509d-22c7-4a2… http://www.… Plantae Trach… Magn… Sapi… Anaca… Schi… Schinu…
 6 899955985 50c9509d-22c7-4a2… http://cona… Plantae Trach… Magn… Sapi… Anaca… Schi… Schinu…
 7 899954857 50c9509d-22c7-4a2… http://www.… Plantae Trach… Magn… Sapi… Anaca… Schi… Schinu…
 8 899951193 50c9509d-22c7-4a2… http://www.… Plantae Trach… Magn… Sapi… Anaca… Schi… Schinu…
 9 899951160 50c9509d-22c7-4a2… http://www.… Plantae Trach… Magn… Sapi… Anaca… Schi… Schinu…
10 899951147 50c9509d-22c7-4a2… http://www.… Plantae Trach… Magn… Sapi… Anaca… Schi… Schinu…
# ℹ 9,156 more rows
# ℹ 41 more variables: infraspecificEpithet <chr>, taxonRank <chr>, scientificName <chr>,
#   verbatimScientificName <chr>, verbatimScientificNameAuthorship <chr>,
#   countryCode <chr>, locality <chr>, stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>,
#   individualCount <int>, publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>,
#   decimalLongitude <dbl>, coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>,
#   elevation <dbl>, elevationAccuracy <dbl>, depth <dbl>, depthAccuracy <dbl>, …

Il y a 9 166 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :

Figure 228.1: Occurrences de Schinus molle dans le monde.

228.1.1 Données par région

On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.

[1] 0.2001963779

[1] 0.2741653938

[1] 0.0001090988436

Espèce non endémique