84 Trema orientalis
84.1 Données d’occurrences GBIF
Collecte des données du GBIF :
<<gbif download metadata>>
Status: SUCCEEDED
DOI: 10.15468/dl.3z9s8j
Format: SIMPLE_CSV
Download key: 0252185-230224095556074
Created: 2023-05-20T12:18:26.791+00:00
Modified: 2023-05-20T12:19:31.255+00:00
Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0252185-230224095556074.zip
Total records: 3052Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et
exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du
tableau) :
Simple feature collection with 3052 features and 50 fields
Attribute-geometry relationship: 50 constant, 0 aggregate, 0 identity
Geometry type: POINT
Dimension: XY
Bounding box: xmin: -175.026 ymin: -32.216 xmax: 169.44069 ymax: 30.317
Geodetic CRS: WGS 84
# A tibble: 3,052 × 51
gbifID datasetKey occurrenceID kingdom phylum class order family genus species infraspecificEpithet
* <int64> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <lgl>
1 9e8 cd6e21c8-… http://spec… Plantae Trach… Magn… Rosa… Canna… Trema Trema … NA
2 9e8 cd6e21c8-… http://spec… Plantae Trach… Magn… Rosa… Canna… Trema Trema … NA
3 9e8 cd6e21c8-… http://spec… Plantae Trach… Magn… Rosa… Canna… Trema Trema … NA
4 9e8 cd6e21c8-… http://spec… Plantae Trach… Magn… Rosa… Canna… Trema Trema … NA
5 9e8 cd6e21c8-… http://spec… Plantae Trach… Magn… Rosa… Canna… Trema Trema … NA
6 9e8 cd6e21c8-… http://spec… Plantae Trach… Magn… Rosa… Canna… Trema Trema … NA
7 9e8 cd6e21c8-… http://spec… Plantae Trach… Magn… Rosa… Canna… Trema Trema … NA
8 9e8 cd6e21c8-… http://spec… Plantae Trach… Magn… Rosa… Canna… Trema Trema … NA
9 9e8 cd6e21c8-… http://spec… Plantae Trach… Magn… Rosa… Canna… Trema Trema … NA
10 9e8 cd6e21c8-… http://spec… Plantae Trach… Magn… Rosa… Canna… Trema Trema … NA
# ℹ 3,042 more rows
# ℹ 40 more variables: taxonRank <chr>, scientificName <chr>, verbatimScientificName <chr>,
# verbatimScientificNameAuthorship <chr>, countryCode <chr>, locality <chr>, stateProvince <chr>,
# occurrenceStatus <chr>, individualCount <int>, publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>,
# decimalLongitude <dbl>, coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>,
# elevation <dbl>, elevationAccuracy <dbl>, depth <lgl>, depthAccuracy <lgl>, eventDate <dttm>,
# day <int>, month <int>, year <int>, taxonKey <int>, speciesKey <int>, basisOfRecord <chr>, …Il y a 3 052 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :
Figure 84.1: Occurrences de Trema orientalis dans le monde.
84.1.1 Données par région
On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.
[1] 0[1] 0.0006553079948[1] 0.1703800786Espèce non endémique