238 Aesculus flava

238.1 Données d’occurrences GBIF

Collecte des données du GBIF :

<<gbif download metadata>>
  Status: SUCCEEDED
  DOI: 10.15468/dl.69rsv5
  Format: SIMPLE_CSV
  Download key: 0011902-230828120925497
  Created: 2023-09-11T11:31:26.580+00:00
  Modified: 2023-09-11T11:32:27.061+00:00
  Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0011902-230828120925497.zip
  Total records: 590

Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du tableau) :

Simple feature collection with 590 features and 50 fields
Attribute-geometry relationships: constant (50)
Geometry type: POINT
Dimension:     XY
Bounding box:  xmin: -122.294582 ymin: -37.808389 xmax: 176.045278 ymax: 63.434
Geodetic CRS:  WGS 84
# A tibble: 590 × 51
     gbifID datasetKey occurrenceID kingdom phylum class order family genus species infraspecificEpithet
 *  <int64> <chr>      <chr>        <chr>   <chr>  <chr> <chr> <chr>  <chr> <chr>   <lgl>               
 1     3.e9 5f06e39d-… USFS - New … Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc… Aescul… NA                  
 2     3.e9 5f06e39d-… USFS - New … Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc… Aescul… NA                  
 3     9 e8 38b4c89f-… urn:lsid:ar… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc… Aescul… NA                  
 4     9 e8 38b4c89f-… urn:lsid:ar… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc… Aescul… NA                  
 5     9 e8 0096dfc0-… http://bioi… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc… Aescul… NA                  
 6     9 e8 0096dfc0-… http://bioi… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc… Aescul… NA                  
 7     9 e8 0096dfc0-… http://bioi… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc… Aescul… NA                  
 8     9 e8 0096dfc0-… http://bioi… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc… Aescul… NA                  
 9     9 e8 0096dfc0-… http://bioi… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc… Aescul… NA                  
10     9 e8 0096dfc0-… http://bioi… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc… Aescul… NA                  
# ℹ 580 more rows
# ℹ 40 more variables: taxonRank <chr>, scientificName <chr>, verbatimScientificName <chr>,
#   verbatimScientificNameAuthorship <chr>, countryCode <chr>, locality <chr>, stateProvince <chr>,
#   occurrenceStatus <chr>, individualCount <int>, publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>,
#   decimalLongitude <dbl>, coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>,
#   elevation <dbl>, elevationAccuracy <dbl>, depth <lgl>, depthAccuracy <lgl>, eventDate <dttm>,
#   day <int>, month <int>, year <int>, taxonKey <int>, speciesKey <int>, basisOfRecord <chr>, …

Il y a 590 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :

Figure 238.1: Occurrences de Aesculus flava dans le monde.

238.1.1 Données par région

On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.

[1] 0.2220338983

[1] 0.7762711864

[1] 0

Espèce endémique d’Amérique du Nord

Figure 238.2: Occurrence de Aesculus flava dans la région d’endémisme.

238.1.2 Licences

On s’intéresse ici au problème particulier des licences :

   CC_BY_4_0 CC_BY_NC_4_0      CC0_1_0 
          60          323           75 

[1] 29.47598253

Figure 238.3: Occurrence de Aesculus flava dans la région d’endémisme, selon la licence : CC BY-NC en bleu ; CC0 et CC BY en orange.

Idéalement, on aimerait avoir au moins 50 % de données vraiment libres d’utilisation (c’est-à-dire sans la clause -NC). On continue en supprimant les données en CC BY-NC.

Moins de 50 % de données librement utilisables

[1] 135

Moins de 500 occurrences utilisables