283 Agonis flexuosa
283.1 Données d’occurrences GBIF
Collecte des données du GBIF :
<<gbif download metadata>>
Status: SUCCEEDED
DOI: 10.15468/dl.bkq6p7
Format: SIMPLE_CSV
Download key: 0018298-230828120925497
Created: 2023-09-16T09:23:44.862+00:00
Modified: 2023-09-16T09:24:24.659+00:00
Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0018298-230828120925497.zip
Total records: 596Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et
exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du
tableau) :
Simple feature collection with 596 features and 50 fields
Attribute-geometry relationships: constant (50)
Geometry type: POINT
Dimension: XY
Bounding box: xmin: -122.457 ymin: -41.07553 xmax: 176.2579 ymax: 40.43912
Geodetic CRS: WGS 84
# A tibble: 596 × 51
gbifID datasetKey occurrenceID kingdom phylum class order family genus
* <int64> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr>
1 891094151 50c9509d-22c… http://www.… Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Agon…
2 4071281429 0645ccdb-e00… 3d06f2c3-fa… Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Agon…
3 4068364328 d0963cee-1a2… urn:catalog… Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Agon…
4 4068362317 d0963cee-1a2… urn:catalog… Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Agon…
5 4061232701 e053ff53-c15… urn:catalog… Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Agon…
6 4033048263 37beb6ea-e59… 1aa21dd0-dd… Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Agon…
7 4017024490 5d7f5915-056… 3c5788a6-77… Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Agon…
8 4017009315 5d7f5915-056… 2e6eea14-ec… Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Agon…
9 4016923300 5d7f5915-056… 44e50033-43… Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Agon…
10 4009787636 50c9509d-22c… https://www… Plantae Trach… Magn… Myrt… Myrta… Agon…
# ℹ 586 more rows
# ℹ 42 more variables: species <chr>, infraspecificEpithet <chr>,
# taxonRank <chr>, scientificName <chr>, verbatimScientificName <chr>,
# verbatimScientificNameAuthorship <chr>, countryCode <chr>, locality <chr>,
# stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>, individualCount <int>,
# publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>, decimalLongitude <dbl>,
# coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>, …Il y a 596 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :
Figure 283.1: Occurrences de Agonis flexuosa dans le monde.
283.1.1 Données par région
On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.
[1] 0[1] 0.03355705[1] 0Espèce non endémique