19 Lagerstroemia indica
19.1 Données d’occurrences GBIF
Collecte des données du GBIF :
<<gbif download metadata>>
Status: SUCCEEDED
DOI: 10.15468/dl.x3f85h
Format: SIMPLE_CSV
Download key: 0230934-230224095556074
Created: 2023-05-10T20:52:23.666+00:00
Modified: 2023-05-10T20:53:06.053+00:00
Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0230934-230224095556074.zip
Total records: 1078Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et
exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du
tableau) :
Simple feature collection with 1078 features and 50 fields
Attribute-geometry relationship: 50 constant, 0 aggregate, 0 identity
Geometry type: POINT
Dimension: XY
Bounding box: xmin: -149.817 ymin: -37.8167 xmax: 153.562571 ymax: 63.434
Geodetic CRS: WGS 84
# A tibble: 1,078 × 51
gbifID datasetKey occurrenceID kingdom phylum class order family genus species infraspecificEpithet
* <int64> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr>
1 9 e8 0096dfc0-… "http://bio… Plantae Trach… Magn… Myrt… Lythr… Lage… Lagers… ""
2 9 e8 0096dfc0-… "http://bio… Plantae Trach… Magn… Myrt… Lythr… Lage… Lagers… ""
3 9 e8 0096dfc0-… "http://bio… Plantae Trach… Magn… Myrt… Lythr… Lage… Lagers… ""
4 9 e8 0096dfc0-… "http://bio… Plantae Trach… Magn… Myrt… Lythr… Lage… Lagers… ""
5 9 e8 0096dfc0-… "http://bio… Plantae Trach… Magn… Myrt… Lythr… Lage… Lagers… ""
6 9 e8 0096dfc0-… "http://bio… Plantae Trach… Magn… Myrt… Lythr… Lage… Lagers… ""
7 9 e8 6ac3f774-… "" Plantae Trach… Magn… Myrt… Lythr… Lage… Lagers… ""
8 9 e8 1b412457-… "5410324" Plantae Trach… Magn… Myrt… Lythr… Lage… Lagers… ""
9 8 e8 29d56be4-… "TAI221578" Plantae Trach… Magn… Myrt… Lythr… Lage… Lagers… ""
10 7.e8 aab0cf80-… "LD:General… Plantae Trach… Magn… Myrt… Lythr… Lage… Lagers… ""
# ℹ 1,068 more rows
# ℹ 40 more variables: taxonRank <chr>, scientificName <chr>, verbatimScientificName <chr>,
# verbatimScientificNameAuthorship <chr>, countryCode <chr>, locality <chr>, stateProvince <chr>,
# occurrenceStatus <chr>, individualCount <int>, publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>,
# decimalLongitude <dbl>, coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>,
# elevation <dbl>, elevationAccuracy <dbl>, depth <dbl>, depthAccuracy <dbl>, eventDate <dttm>,
# day <int>, month <int>, year <int>, taxonKey <int>, speciesKey <int>, basisOfRecord <chr>, …Il y a 1 078 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :
Figure 19.1: Occurrences de Lagerstroemia indica dans le monde.
19.1.1 Données par région
On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.
[1] 0.04638218924[1] 0.280148423[1] 0.3395176252Espèce non endémique