193 Carpinus orientalis

193.1 Données d’occurrences GBIF

Collecte des données du GBIF :

<<gbif download metadata>>
  Status: SUCCEEDED
  DOI: 10.15468/dl.qxa23p
  Format: SIMPLE_CSV
  Download key: 0260757-230224095556074
  Created: 2023-05-25T09:28:47.137+00:00
  Modified: 2023-05-25T09:29:46.319+00:00
  Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0260757-230224095556074.zip
  Total records: 625

Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du tableau) :

Simple feature collection with 625 features and 50 fields
Attribute-geometry relationship: 50 constant, 0 aggregate, 0 identity
Geometry type: POINT
Dimension:     XY
Bounding box:  xmin: -78.698658 ymin: 35.794421 xmax: 48.11437 ymax: 56.684147
Geodetic CRS:  WGS 84
# A tibble: 625 × 51
      gbifID datasetKey         occurrenceID kingdom phylum class order family genus species
 *   <int64> <chr>              <chr>        <chr>   <chr>  <chr> <chr> <chr>  <chr> <chr>  
 1 920897274 6ac3f774-d9fb-479… ""           Plantae Trach… Magn… Faga… Betul… Carp… Carpin…
 2 920894399 6ac3f774-d9fb-479… ""           Plantae Trach… Magn… Faga… Betul… Carp… Carpin…
 3 920887253 6ac3f774-d9fb-479… ""           Plantae Trach… Magn… Faga… Betul… Carp… Carpin…
 4 920885223 6ac3f774-d9fb-479… ""           Plantae Trach… Magn… Faga… Betul… Carp… Carpin…
 5 895207054 834a4794-f762-11e… "1BFCBD83-A… Plantae Trach… Magn… Faga… Betul… Carp… Carpin…
 6 895179932 834a4794-f762-11e… "0705C561-B… Plantae Trach… Magn… Faga… Betul… Carp… Carpin…
 7 895179607 834a4794-f762-11e… "BE22C596-3… Plantae Trach… Magn… Faga… Betul… Carp… Carpin…
 8 893460580 85714c48-f762-11e… "https://he… Plantae Trach… Magn… Faga… Betul… Carp… Carpin…
 9 788645824 aab0cf80-0c64-11d… "LD:General… Plantae Trach… Magn… Faga… Betul… Carp… Carpin…
10 788645766 aab0cf80-0c64-11d… "LD:General… Plantae Trach… Magn… Faga… Betul… Carp… Carpin…
# ℹ 615 more rows
# ℹ 41 more variables: infraspecificEpithet <chr>, taxonRank <chr>, scientificName <chr>,
#   verbatimScientificName <chr>, verbatimScientificNameAuthorship <chr>,
#   countryCode <chr>, locality <chr>, stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>,
#   individualCount <int>, publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>,
#   decimalLongitude <dbl>, coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>,
#   elevation <dbl>, elevationAccuracy <dbl>, depth <lgl>, depthAccuracy <lgl>, …

Il y a 625 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :

Figure 193.1: Occurrences de Carpinus orientalis dans le monde.

193.1.1 Données par région

On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.

[1] 0.9936

[1] 0.0048

[1] 0

Espèce endémique d’Europe

Figure 193.2: Occurrence de Carpinus orientalis dans la région d’endémisme.

193.1.2 Licences

On s’intéresse ici au problème particulier des licences :

   CC_BY_4_0 CC_BY_NC_4_0      CC0_1_0 
         267          200          154 

[1] 67.79388084

Figure 193.3: Occurrence de Carpinus orientalis dans la région d’endémisme, selon la licence : CC BY-NC en bleu ; CC0 et CC BY en orange.

Idéalement, on aimerait avoir au moins 50 % de données vraiment libres d’utilisation (c’est-à-dire sans la clause -NC). On continue en supprimant les données en CC BY-NC.

[1] 421

Moins de 500 occurrences utilisables