196 Casuarina cunninghamiana

196.1 Données d’occurrences GBIF

Collecte des données du GBIF :

<<gbif download metadata>>
  Status: SUCCEEDED
  DOI: 10.15468/dl.3p6ad4
  Format: SIMPLE_CSV
  Download key: 0260767-230224095556074
  Created: 2023-05-25T09:33:08.068+00:00
  Modified: 2023-05-25T09:34:08.719+00:00
  Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0260767-230224095556074.zip
  Total records: 10148

Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du tableau) :

Simple feature collection with 10148 features and 50 fields
Attribute-geometry relationship: 50 constant, 0 aggregate, 0 identity
Geometry type: POINT
Dimension:     XY
Bounding box:  xmin: -156.667 ymin: -43.644 xmax: 178.029499 ymax: 59.46983
Geodetic CRS:  WGS 84
# A tibble: 10,148 × 51
       gbifID datasetKey        occurrenceID kingdom phylum class order family genus species
 *    <int64> <chr>             <chr>        <chr>   <chr>  <chr> <chr> <chr>  <chr> <chr>  
 1  910469164 837acfc2-f762-11… HSS:HSS:245… Plantae Trach… Magn… Faga… Casua… Casu… Casuar…
 2  895206446 834a4794-f762-11… BA577DA1-E7… Plantae Trach… Magn… Faga… Casua… Casu… Casuar…
 3  895178227 834a4794-f762-11… 78474283-84… Plantae Trach… Magn… Faga… Casua… Casu… Casuar…
 4  895140877 834a4794-f762-11… DED2DE3C-7E… Plantae Trach… Magn… Faga… Casua… Casu… Casuar…
 5  781075179 962cceea-f762-11… MGC:MGC-Cor… Plantae Trach… Magn… Faga… Casua… Casu… Casuar…
 6 4115809656 d0963cee-1a29-47… urn:catalog… Plantae Trach… Magn… Faga… Casua… Casu… Casuar…
 7 4115807666 d0963cee-1a29-47… urn:catalog… Plantae Trach… Magn… Faga… Casua… Casu… Casuar…
 8 4091893302 50c9509d-22c7-4a… https://www… Plantae Trach… Magn… Faga… Casua… Casu… Casuar…
 9 4091684311 50c9509d-22c7-4a… https://www… Plantae Trach… Magn… Faga… Casua… Casu… Casuar…
10 4091680319 50c9509d-22c7-4a… https://www… Plantae Trach… Magn… Faga… Casua… Casu… Casuar…
# ℹ 10,138 more rows
# ℹ 41 more variables: infraspecificEpithet <chr>, taxonRank <chr>, scientificName <chr>,
#   verbatimScientificName <chr>, verbatimScientificNameAuthorship <chr>,
#   countryCode <chr>, locality <chr>, stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>,
#   individualCount <int>, publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>,
#   decimalLongitude <dbl>, coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>,
#   elevation <dbl>, elevationAccuracy <dbl>, depth <dbl>, depthAccuracy <dbl>, …

Il y a 10 148 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :

Figure 196.1: Occurrences de Casuarina cunninghamiana dans le monde.

196.1.1 Données par région

On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.

[1] 0.01399290501

[1] 0.004138746551

[1] 0.0003941663382

Espèce non endémique