293 Aesculus carnea

293.1 Données d’occurrences GBIF

Collecte des données du GBIF :

<<gbif download metadata>>
  Status: SUCCEEDED
  DOI: 10.15468/dl.tug9hm
  Format: SIMPLE_CSV
  Download key: 0018315-230828120925497
  Created: 2023-09-16T09:39:04.280+00:00
  Modified: 2023-09-16T09:39:46.414+00:00
  Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0018315-230828120925497.zip
  Total records: 642

Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du tableau) :

Simple feature collection with 609 features and 50 fields
Attribute-geometry relationships: constant (50)
Geometry type: POINT
Dimension:     XY
Bounding box:  xmin: -122.035 ymin: -38.56219 xmax: 177.7208 ymax: 59.29296
Geodetic CRS:  WGS 84
# A tibble: 609 × 51
       gbifID datasetKey    occurrenceID kingdom phylum class order family genus
 *    <int64> <chr>         <chr>        <chr>   <chr>  <chr> <chr> <chr>  <chr>
 1 3393532752 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc…
 2 3051359225 c4e1739b-e22… BISON:New Y… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc…
 3 3393895198 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc…
 4 3393525658 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc…
 5 3393609414 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc…
 6 3393511180 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc…
 7 3393938401 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc…
 8 3393947858 d1e9202b-730… NYCstreetTr… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc…
 9 3051168247 c4e1739b-e22… BISON:New Y… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc…
10 3051364601 c4e1739b-e22… BISON:New Y… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Aesc…
# ℹ 599 more rows
# ℹ 42 more variables: species <chr>, infraspecificEpithet <lgl>,
#   taxonRank <chr>, scientificName <chr>, verbatimScientificName <chr>,
#   verbatimScientificNameAuthorship <chr>, countryCode <chr>, locality <chr>,
#   stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>, individualCount <int>,
#   publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>, decimalLongitude <dbl>,
#   coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>, …

Il y a 609 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :

Figure 293.1: Occurrences de Aesculus carnea dans le monde.

293.1.1 Données par région

On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.

[1] 0.8045977

[1] 0.1888342

[1] 0

Espèce endémique d’Europe

Figure 293.2: Occurrence de Aesculus carnea dans la région d’endémisme.

293.1.2 Licences

On s’intéresse ici au problème particulier des licences :

   CC_BY_4_0 CC_BY_NC_4_0      CC0_1_0 
         419           26           45 

[1] 94.69388

Figure 293.3: Occurrence de Aesculus carnea dans la région d’endémisme, selon la licence : CC BY-NC en bleu ; CC0 et CC BY en orange.

Idéalement, on aimerait avoir au moins 50 % de données vraiment libres d’utilisation (c’est-à-dire sans la clause -NC). On continue en supprimant les données en CC BY-NC.

[1] 464

Moins de 500 occurrences utilisables