206 Fagus orientalis
206.1 Données d’occurrences GBIF
Collecte des données du GBIF :
<<gbif download metadata>>
Status: SUCCEEDED
DOI: 10.15468/dl.fewzz9
Format: SIMPLE_CSV
Download key: 0260827-230224095556074
Created: 2023-05-25T10:54:16.817+00:00
Modified: 2023-05-25T10:55:00.962+00:00
Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0260827-230224095556074.zip
Total records: 882Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et
exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du
tableau) :
Simple feature collection with 882 features and 50 fields
Attribute-geometry relationship: 50 constant, 0 aggregate, 0 identity
Geometry type: POINT
Dimension: XY
Bounding box: xmin: -2.15 ymin: 36.043075 xmax: 53.22719 ymax: 56.6825
Geodetic CRS: WGS 84
# A tibble: 882 × 51
gbifID datasetKey occurrenceID kingdom phylum class order family genus species
* <int64> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr>
1 991748070 bf2a4bf0-5f31-11d… "http://dat… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Fagus Fagus …
2 921705699 6ac3f774-d9fb-479… "" Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Fagus Fagus …
3 921691367 6ac3f774-d9fb-479… "" Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Fagus Fagus …
4 921678108 6ac3f774-d9fb-479… "" Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Fagus Fagus …
5 895206780 834a4794-f762-11e… "274C4AF0-D… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Fagus Fagus …
6 895192751 834a4794-f762-11e… "4EAC4403-C… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Fagus Fagus …
7 730891877 b5cdf794-8fa4-4a8… "http://col… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Fagus Fagus …
8 730891875 b5cdf794-8fa4-4a8… "http://col… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Fagus Fagus …
9 730891834 b5cdf794-8fa4-4a8… "http://col… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Fagus Fagus …
10 730891828 b5cdf794-8fa4-4a8… "http://col… Plantae Trach… Magn… Faga… Fagac… Fagus Fagus …
# ℹ 872 more rows
# ℹ 41 more variables: infraspecificEpithet <chr>, taxonRank <chr>, scientificName <chr>,
# verbatimScientificName <chr>, verbatimScientificNameAuthorship <chr>,
# countryCode <chr>, locality <chr>, stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>,
# individualCount <int>, publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>,
# decimalLongitude <dbl>, coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>,
# elevation <dbl>, elevationAccuracy <dbl>, depth <lgl>, depthAccuracy <lgl>, …Il y a 882 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :
Figure 206.1: Occurrences de Fagus orientalis dans le monde.
206.1.1 Données par région
On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.
[1] 0.2777777778[1] 0[1] 0Espèce non endémique