258 Morus nigra

258.1 Données d’occurrences GBIF

Collecte des données du GBIF :

<<gbif download metadata>>
  Status: SUCCEEDED
  DOI: 10.15468/dl.dksw2m
  Format: SIMPLE_CSV
  Download key: 0015670-230828120925497
  Created: 2023-09-13T14:17:26.073+00:00
  Modified: 2023-09-13T14:18:30.163+00:00
  Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0015670-230828120925497.zip
  Total records: 1615

Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du tableau) :

Simple feature collection with 1615 features and 50 fields
Attribute-geometry relationships: constant (50)
Geometry type: POINT
Dimension:     XY
Bounding box:  xmin: -159.7433 ymin: -43.57186 xmax: 172.6266 ymax: 63.434
Geodetic CRS:  WGS 84
# A tibble: 1,615 × 51
      gbifID datasetKey     occurrenceID kingdom phylum class order family genus
 *   <int64> <chr>          <chr>        <chr>   <chr>  <chr> <chr> <chr>  <chr>
 1 986394024 2429287b-ef65… "urn:catalo… Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 2 922409520 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 3 922408920 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 4 922407580 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 5 922406848 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 6 922406725 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 7 922406024 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 8 922405208 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 9 922403915 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
10 922403110 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
# ℹ 1,605 more rows
# ℹ 42 more variables: species <chr>, infraspecificEpithet <lgl>,
#   taxonRank <chr>, scientificName <chr>, verbatimScientificName <chr>,
#   verbatimScientificNameAuthorship <chr>, countryCode <chr>, locality <chr>,
#   stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>, individualCount <int>,
#   publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>, decimalLongitude <dbl>,
#   coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>, …

Il y a 1 615 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :

Occurrences de Morus nigra dans le monde.

Figure 258.1: Occurrences de Morus nigra dans le monde.

258.1.1 Données par région

On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.

[1] 0.7634675
[1] 0.03467492
[1] 0.009907121

Espèce endémique d’Europe

Occurrence de Morus nigra dans la région d'endémisme.

Figure 258.2: Occurrence de Morus nigra dans la région d’endémisme.

258.1.2 Licences

On s’intéresse ici au problème particulier des licences :


                                                  CC_BY_4_0 
                                                        831 
                                               CC_BY_NC_4_0 
                                                        209 
                                                    CC0_1_0 
                                                         38 
   https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/legalcode 
                                                         73 
      https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode 
                                                         79 
https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/legalcode 
                                                          3 
[1] 77.12895
Occurrence de Morus nigra dans la région d'endémisme, selon la licence : CC BY-NC en bleu ; CC0 et CC BY en orange.

Figure 258.3: Occurrence de Morus nigra dans la région d’endémisme, selon la licence : CC BY-NC en bleu ; CC0 et CC BY en orange.

Idéalement, on aimerait avoir au moins 50 % de données vraiment libres d’utilisation (c’est-à-dire sans la clause -NC). On continue en supprimant les données en CC BY-NC.

[1] 951

258.1.3 Sous-échantillonnage

Si le jeu de données contient 25 000 occurrences ou plus, on procède au sous-échantillonnage aléatoire pour en conserver un maximum de 25 000.

Moins de 25 000 occurrences : pas de sous-échantillonnage

Simple feature collection with 951 features and 50 fields
Attribute-geometry relationships: constant (50)
Geometry type: POINT
Dimension:     XY
Bounding box:  xmin: -9.238889 ymin: 31.2 xmax: 44.80144 ymax: 63.434
Geodetic CRS:  WGS 84
# A tibble: 951 × 51
      gbifID datasetKey     occurrenceID kingdom phylum class order family genus
     <int64> <chr>          <chr>        <chr>   <chr>  <chr> <chr> <chr>  <chr>
 1 922409520 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 2 922408920 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 3 922407580 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 4 922406848 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 5 922406725 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 6 922406024 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 7 922405208 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 8 922403915 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
 9 922403110 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
10 922402877 6ac3f774-d9fb… ""           Plantae Trach… Magn… Rosa… Morac… Morus
# ℹ 941 more rows
# ℹ 42 more variables: species <chr>, infraspecificEpithet <lgl>,
#   taxonRank <chr>, scientificName <chr>, verbatimScientificName <chr>,
#   verbatimScientificNameAuthorship <chr>, countryCode <chr>, locality <chr>,
#   stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>, individualCount <int>,
#   publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>, decimalLongitude <dbl>,
#   coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <dbl>, …

258.1.4 Carte finale

On prépare la carte finale des occurrences :

Occurrence de Morus nigra dans la région d'endémisme après sous-échantillonnage éventuel.

Figure 258.4: Occurrence de Morus nigra dans la région d’endémisme après sous-échantillonnage éventuel.

258.2 Modélisation de la niche climatique

258.2.1 Préparer les données

Organisation des données d’entrées (occurrences et données environnementales) et des données produites de pseudo-absences :

 class       : SpatVector 
 geometry    : points 
 dimensions  : 951, 0  (geometries, attributes)
 extent      : -9.238889, 44.80144, 31.2, 63.434  (xmin, xmax, ymin, ymax)
 coord. ref. : lon/lat WGS 84 (EPSG:4326) 

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= moni Data Formating -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

      ! Response variable is considered as only presences... Is it really what you want?
      ! No data has been set aside for modeling evaluation
 !!! Some data are located in the same raster cell. 
          Please set `filter.raster = TRUE` if you want an automatic filtering.

Checking Pseudo-absence selection arguments...

   > random pseudo absences selection
   > Pseudo absences are selected in explanatory variables
 ! Some NAs have been automatically removed from your data
 !!! Some data are located in the same raster cell. 
          Please set `filter.raster = TRUE` if you want an automatic filtering.
-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= Done -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= BIOMOD.formated.data -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

dir.name =  Output

sp.name =  moni

     950 presences,  0 true absences and  2850 undefined points in dataset


     6 explanatory variables

 temp_max_august     temp_min       temp_wet_quart    temp_season    
 Min.   : 4.564   Min.   :-21.592   Min.   :-8.183   Min.   : 202.1  
 1st Qu.:20.935   1st Qu.: -8.569   1st Qu.: 9.399   1st Qu.: 628.1  
 Median :25.068   Median : -1.982   Median :13.117   Median : 731.2  
 Mean   :25.645   Mean   : -3.619   Mean   :12.517   Mean   : 756.1  
 3rd Qu.:29.112   3rd Qu.:  1.589   3rd Qu.:16.412   3rd Qu.: 899.9  
 Max.   :44.756   Max.   : 10.417   Max.   :23.019   Max.   :1309.8  
 prec_wet_quart    prec_season     
 Min.   :   7.0   Min.   :  8.038  
 1st Qu.: 174.0   1st Qu.: 23.488  
 Median : 217.0   Median : 31.809  
 Mean   : 221.1   Mean   : 36.685  
 3rd Qu.: 263.0   3rd Qu.: 42.434  
 Max.   :1121.0   Max.   :121.810  

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

On visualise les pseudo-absences :

Les données d'occurrences (en haut à gauche) et les trois jeux de données aléatoires de pseudo-absences.

Figure 258.5: Les données d’occurrences (en haut à gauche) et les trois jeux de données aléatoires de pseudo-absences.

$data.vect
 class       : SpatVector 
 geometry    : points 
 dimensions  : 6653, 2  (geometries, attributes)
 extent      : -10.1875, 46.97917, 29.02083, 70.9375  (xmin, xmax, ymin, ymax)
 coord. ref. :  
 names       :  resp         dataset
 type        : <num>           <chr>
 values      :    10 Initial dataset
                  10 Initial dataset
                  10 Initial dataset

$data.label
                              9                              10 
                "**Presences**"       "Presences (calibration)" 
                             11                              12 
       "Presences (validation)"        "Presences (evaluation)" 
                             19                              20 
            "**True Absences**"   "True Absences (calibration)" 
                             21                              22 
   "True Absences (validation)"    "True Absences (evaluation)" 
                             29                              30 
          "**Pseudo-Absences**" "Pseudo-Absences (calibration)" 
                             31                               1 
 "Pseudo-Absences (validation)"                    "Background" 

$data.plot
Les données d'occurrences (en haut à gauche) et les trois jeux de données aléatoires de pseudo-absences.

Figure 258.6: Les données d’occurrences (en haut à gauche) et les trois jeux de données aléatoires de pseudo-absences.

258.2.2 Modèles individuels de niche


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= Build Single Models -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=


Checking Models arguments...

Creating suitable Workdir...

            ! Weights where automatically defined for moni_PA1 to rise a 0.5 prevalence !
            ! Weights where automatically defined for moni_PA2 to rise a 0.5 prevalence !
            ! Weights where automatically defined for moni_PA3 to rise a 0.5 prevalence !


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= moni Modeling Summary -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

 6  environmental variables ( temp_max_august temp_min temp_wet_quart temp_season prec_wet_quart prec_season )
Number of evaluation repetitions : 1
Models selected : GAM MARS MAXNET GBM ANN RF 

Total number of model runs: 18 

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=


-=-=-=- Run :  moni_PA1 


-=-=-=--=-=-=- moni_PA1_RUN1 


-=-=-=- Run :  moni_PA2 


-=-=-=--=-=-=- moni_PA2_RUN1 


-=-=-=- Run :  moni_PA3 


-=-=-=--=-=-=- moni_PA3_RUN1 

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= Done -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

258.2.2.1 Évaluation de la performance

             full.name  PA  run   algo metric.eval cutoff sensitivity
1    moni_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1    GAM         TSS  525.0      96.447
2    moni_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1    GAM         ROC  526.0      96.447
3   moni_PA1_RUN1_MARS PA1 RUN1   MARS         TSS  451.0      87.895
4   moni_PA1_RUN1_MARS PA1 RUN1   MARS         ROC  449.5      88.026
5 moni_PA1_RUN1_MAXNET PA1 RUN1 MAXNET         TSS  403.0      89.342
6 moni_PA1_RUN1_MAXNET PA1 RUN1 MAXNET         ROC  402.5      89.342
  specificity calibration validation evaluation
1      55.979       0.524      0.553         NA
2      55.979       0.707      0.727         NA
3      80.026       0.679      0.658         NA
4      80.026       0.914      0.891         NA
5      79.238       0.684      0.674         NA
6      79.238       0.915      0.900         NA
Évaluation de la performance des modèles individuels : True Skill Statistic & aire sous la courbe de ROC.

Figure 258.7: Évaluation de la performance des modèles individuels : True Skill Statistic & aire sous la courbe de ROC.

258.2.2.2 Importance des variables environnementales

          full.name  PA  run algo        expl.var rand  var.imp
1 moni_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1  GAM temp_max_august    1 0.393278
2 moni_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1  GAM        temp_min    1 0.362169
3 moni_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1  GAM  temp_wet_quart    1 0.060253
4 moni_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1  GAM     temp_season    1 0.195261
5 moni_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1  GAM  prec_wet_quart    1 0.036050
6 moni_PA1_RUN1_GAM PA1 RUN1  GAM     prec_season    1 0.000148
Pourcentage de variance expliquée pour chaque variable, décomposé par algorithme.

Figure 258.8: Pourcentage de variance expliquée pour chaque variable, décomposé par algorithme.

Pourcentage de variance expliquée pour chaque variable, décomposé par variable.

Figure 258.9: Pourcentage de variance expliquée pour chaque variable, décomposé par variable.

258.2.2.3 Courbes de réponses

Courbes de réponse de chaque variable climatique selon l'algorithme (en couleurs).

Figure 258.10: Courbes de réponse de chaque variable climatique selon l’algorithme (en couleurs).

258.2.3 Modèles d’ensemble de niche

Seulement modèles avec TSS > 0.8


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= BIOMOD.ensemble.models.out -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

sp.name : moni

expl.var.names : temp_max_august temp_min temp_wet_quart temp_season 
prec_wet_quart prec_season


models computed: 
moni_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo, moni_EMwmeanByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo

models failed: none

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

258.2.3.1 Évaluation de la qualité

                                          full.name merged.by.PA merged.by.run
1 moni_EMwmeanByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
2 moni_EMwmeanByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
  merged.by.algo filtered.by    algo metric.eval cutoff sensitivity specificity
1     mergedAlgo         TSS EMwmean         TSS  636.0      94.526      95.579
2     mergedAlgo         TSS EMwmean         ROC  638.5      94.526      95.719
  calibration validation evaluation
1       0.902         NA         NA
2       0.990         NA         NA
Évaluation de la qualité du modèle d'ensemble : Aire sous la courbe de ROC & True Skill Statistic.

Figure 258.11: Évaluation de la qualité du modèle d’ensemble : Aire sous la courbe de ROC & True Skill Statistic.

                                       full.name merged.by.PA merged.by.run
1 moni_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
2 moni_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
3 moni_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
4 moni_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
5 moni_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
6 moni_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo   mergedData     mergedRun
  merged.by.algo filtered.by algo        expl.var rand  var.imp
1     mergedAlgo         TSS EMcv temp_max_august    1 0.494527
2     mergedAlgo         TSS EMcv        temp_min    1 0.536192
3     mergedAlgo         TSS EMcv  temp_wet_quart    1 0.281643
4     mergedAlgo         TSS EMcv     temp_season    1 0.434142
5     mergedAlgo         TSS EMcv  prec_wet_quart    1 0.458030
6     mergedAlgo         TSS EMcv     prec_season    1 0.358251

Par variable :

Pourcentage de variance expliquée par variable dans le modèle d'ensemble.

Figure 258.12: Pourcentage de variance expliquée par variable dans le modèle d’ensemble.

Courbes de réponse de chaque variable climatique dans le modèle d'ensemble.

Figure 258.13: Courbes de réponse de chaque variable climatique dans le modèle d’ensemble.

258.3 Projections

258.3.1 Distribution potentielle contemporaine

Contemporaine : Cartographie des observations sur couches climatiques Extraction des conditions climatiques favorables


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= BIOMOD.projection.out -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

Projection directory : Output/moni/current


sp.name : moni

expl.var.names : temp_max_august temp_min temp_wet_quart temp_season 
prec_wet_quart prec_season


modeling.id : AllModels ( Output/moni/moni.AllModels.models.out )

models.projected : 
moni_PA1_RUN1_GAM, moni_PA1_RUN1_MARS, moni_PA1_RUN1_MAXNET, moni_PA1_RUN1_GBM, moni_PA1_RUN1_ANN, moni_PA1_RUN1_RF, moni_PA2_RUN1_GAM, moni_PA2_RUN1_MARS, moni_PA2_RUN1_MAXNET, moni_PA2_RUN1_GBM, moni_PA2_RUN1_RF, moni_PA3_RUN1_GAM, moni_PA3_RUN1_MARS, moni_PA3_RUN1_MAXNET, moni_PA3_RUN1_GBM, moni_PA3_RUN1_ANN, moni_PA3_RUN1_RF

available binary projection : TSS, ROC

available filtered projection : TSS, ROC

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=
Projection de la distribution potentielle contemporaine sur l'Europe, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.

Figure 258.14: Projection de la distribution potentielle contemporaine sur l’Europe, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.

Projection de la distribution potentielle contemporaine sur l'Europe, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.

Figure 258.15: Projection de la distribution potentielle contemporaine sur l’Europe, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= BIOMOD.projection.out -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

Projection directory : Output/moni/current


sp.name : moni

expl.var.names : temp_max_august temp_min temp_wet_quart temp_season 
prec_wet_quart prec_season


modeling.id : AllModels ( Output/moni/moni.AllModels.ensemble.models.out )

models.projected : 
moni_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo, moni_EMwmeanByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=
A) Projection de la distribution potentielle contemporaine (modèle d'ensemble) ; B) Incertitude associée à la projection.

Figure 258.16: A) Projection de la distribution potentielle contemporaine (modèle d’ensemble) ; B) Incertitude associée à la projection.

258.3.2 Interpolation à l’échelle de la métropole

  • → conditions climatiques favorables à fine échelle

On projette la niche climatique sur ce raster à fine échelle.


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= BIOMOD.projection.out -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

Projection directory : Output/moni/cont_gre


sp.name : moni

expl.var.names : temp_max_august temp_min temp_wet_quart temp_season 
prec_wet_quart prec_season


modeling.id : AllModels ( Output/moni/moni.AllModels.models.out )

models.projected : 
moni_PA1_RUN1_GAM, moni_PA1_RUN1_MARS, moni_PA1_RUN1_MAXNET, moni_PA1_RUN1_GBM, moni_PA1_RUN1_ANN, moni_PA1_RUN1_RF, moni_PA2_RUN1_GAM, moni_PA2_RUN1_MARS, moni_PA2_RUN1_MAXNET, moni_PA2_RUN1_GBM, moni_PA2_RUN1_RF, moni_PA3_RUN1_GAM, moni_PA3_RUN1_MARS, moni_PA3_RUN1_MAXNET, moni_PA3_RUN1_GBM, moni_PA3_RUN1_ANN, moni_PA3_RUN1_RF

available binary projection : TSS, ROC

available filtered projection : TSS, ROC

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=
Projection de la distribution potentielle contemporaine sur la métropole de Grenoble, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.

Figure 258.17: Projection de la distribution potentielle contemporaine sur la métropole de Grenoble, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.

Projection de la distribution potentielle contemporaine sur la métropole de Grenoble, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.

Figure 258.18: Projection de la distribution potentielle contemporaine sur la métropole de Grenoble, selon les 6 algorithmes et les 3 runs.


-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= BIOMOD.projection.out -=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=

Projection directory : Output/moni/cont_gre


sp.name : moni

expl.var.names : temp_max_august temp_min temp_wet_quart temp_season 
prec_wet_quart prec_season


modeling.id : AllModels ( Output/moni/moni.AllModels.ensemble.models.out )

models.projected : 
moni_EMcvByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo, moni_EMwmeanByTSS_mergedData_mergedRun_mergedAlgo

-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=
A) Projection de la distribution potentielle contemporaine (modèle d'ensemble) sur la métropole de Grenoble ; B) Incertitude associée à la projection.

Figure 258.19: A) Projection de la distribution potentielle contemporaine (modèle d’ensemble) sur la métropole de Grenoble ; B) Incertitude associée à la projection.

258.3.3 Distributions potentielles futures

Futur : Projection à l’échelle de l’Europe jusqu’à l’horizon 2100

Toutes les fenêtres temporelles × scénarios pour le GCM « IPSL-CM6A-LR »

  1. SSP1-2.6
Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP1-2.6 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP1-2.6 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP1-2.6 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP1-2.6 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP1-2.6 (modèle d'ensemble).

Figure 258.20: Projection des distributions potentielles futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP1-2.6 (modèle d’ensemble).

On obtient pour la métrique TSS une carte unique de moyenne pondérée sur les algorithmes et sur les jeux de pseudo-absences.

  1. SSP2-4.5
Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP2-4.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP2-4.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP2-4.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP2-4.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP2-4.5 (modèle d'ensemble).

Figure 258.21: Projection des distributions potentielles futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP2-4.5 (modèle d’ensemble).

  1. SSP3-7.0
Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP3-7.0 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP3-7.0 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP3-7.0 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP3-7.0 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP3-7.0 (modèle d'ensemble).

Figure 258.22: Projection des distributions potentielles futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP3-7.0 (modèle d’ensemble).

  1. SSP5-8.5
Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble).Projection des distributions potentielles futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble).

Figure 258.23: Projection des distributions potentielles futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d’ensemble).

258.4 Inférence à l’échelle de la métropole

  • Croisement avec températures de surface 2019 (fournie par la métropole)
  • → conditions climatiques favorables à fine échelle
  • à peu près 7 pixels × 9 (WorldClim)

258.4.1 Distributions potentielles futures

Même chose que précédemment mais sur les rasters de Grenoble

  1. SSP1-2.6
Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).

Figure 258.24: Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d’ensemble, GCM IPSL).

  1. SSP2-4.5
Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).

Figure 258.25: Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d’ensemble, GCM IPSL).

  1. SSP3-7.0
Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).

Figure 258.26: Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d’ensemble, GCM IPSL).

  1. SSP5-8.5
Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu'à l'horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d'ensemble, GCM IPSL).

Figure 258.27: Projection des distributions potentielles contemporaine et futures jusqu’à l’horizon 2100 sous le scénario SSP5-8.5 (modèle d’ensemble, GCM IPSL).

258.4.2 Évolution temporelle

# A tibble: 17 × 8
   min         q1          median      mean        q3          max   ssp    year
   <table[1d]> <table[1d]> <table[1d]> <table[1d]> <table[1d]> <tab> <fct> <dbl>
 1 190         527         670         640.6169    747         947   0      2000
 2 228         574         747         717.0185    838         942   126    2040
 3 301         535         709         677.6273    798         960   126    2060
 4 320         565         768         721.2751    841         972   126    2080
 5 297         531         705         672.5088    789         965   126    2100
 6 327         633         756         724.9909    824         944   245    2040
 7 336         544         737         697.6408    829         926   245    2060
 8 412         552         767         708.7120    815         948   245    2080
 9 402         525         688         659.6199    775         888   245    2100
10 235         576         727         710.4395    830         943   370    2040
11 339         534         715         675.8355    795         947   370    2060
12 382         513         674         648.8523    761         886   370    2080
13 368         530         594         624.8163    726         851   370    2100
14 226         578         764         725.3086    847         958   585    2040
15 382         541         749         690.9738    801         939   585    2060
16 378         530         663         657.0023    776         878   585    2080
17 326         521         553         562.2719    603         830   585    2100
Évolution de la favorabilité climatique au cours du XXIème siècle. Le point représente la médiane sur l'étendue de la métropole (i.e. tous les pixels de la carte) ; le trait gras représente 50 % des données intermédiaires (espace inter-quartile) ; le trait fin représente le reste des données du minimum au maximum.

Figure 258.28: Évolution de la favorabilité climatique au cours du XXIème siècle. Le point représente la médiane sur l’étendue de la métropole (i.e. tous les pixels de la carte) ; le trait gras représente 50 % des données intermédiaires (espace inter-quartile) ; le trait fin représente le reste des données du minimum au maximum.