287 Sapindus saponaria

287.1 Données d’occurrences GBIF

Collecte des données du GBIF :

<<gbif download metadata>>
  Status: SUCCEEDED
  DOI: 10.15468/dl.4cgubn
  Format: SIMPLE_CSV
  Download key: 0018304-230828120925497
  Created: 2023-09-16T09:29:31.545+00:00
  Modified: 2023-09-16T09:30:20.727+00:00
  Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0018304-230828120925497.zip
  Total records: 3406

Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du tableau) :

Simple feature collection with 3406 features and 50 fields
Attribute-geometry relationships: constant (50)
Geometry type: POINT
Dimension:     XY
Bounding box:  xmin: -179.9236 ymin: -58.9 xmax: 177.9544 ymax: 63.434
Geodetic CRS:  WGS 84
# A tibble: 3,406 × 51
      gbifID datasetKey     occurrenceID kingdom phylum class order family genus
 *   <int64> <chr>          <chr>        <chr>   <chr>  <chr> <chr> <chr>  <chr>
 1 911784069 de45bd59-54e6… IAVH:BICUB:… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Sapi…
 2 895178240 834a4794-f762… 0DD1BCB1-82… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Sapi…
 3 883353445 0eac2479-e5d8… 9417         Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Sapi…
 4 883353382 0eac2479-e5d8… 9416         Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Sapi…
 5 857853045 fdbbb939-ee0b… WCS-CO-2010… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Sapi…
 6 857852992 fdbbb939-ee0b… WCS-CO-2010… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Sapi…
 7 788776291 aab0cf80-0c64… LD:General:… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Sapi…
 8 768747223 9b73f44e-bbe1… SINCHI:COAH… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Sapi…
 9 768740454 9b73f44e-bbe1… SINCHI:COAH… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Sapi…
10 724046823 bf2a4bf0-5f31… http://data… Plantae Trach… Magn… Sapi… Sapin… Sapi…
# ℹ 3,396 more rows
# ℹ 42 more variables: species <chr>, infraspecificEpithet <chr>,
#   taxonRank <chr>, scientificName <chr>, verbatimScientificName <chr>,
#   verbatimScientificNameAuthorship <chr>, countryCode <chr>, locality <chr>,
#   stateProvince <chr>, occurrenceStatus <chr>, individualCount <int>,
#   publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>, decimalLongitude <dbl>,
#   coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <lgl>, …

Il y a 3 406 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :

Figure 287.1: Occurrences de Sapindus saponaria dans le monde.

287.1.1 Données par région

On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.

[1] 0.0005871991

[1] 0.2706988

[1] 0.005578391

Espèce non endémique