241 Carya alba

241.1 Données d’occurrences GBIF

Collecte des données du GBIF :

<<gbif download metadata>>
  Status: SUCCEEDED
  DOI: 10.15468/dl.rqbnrs
  Format: SIMPLE_CSV
  Download key: 0013532-230828120925497
  Created: 2023-09-11T17:58:17.422+00:00
  Modified: 2023-09-11T17:59:04.824+00:00
  Download link: https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/request/0013532-230828120925497.zip
  Total records: 1200

Conversion en objets géographiques (format Simple feature de sf) et exploration rapide des données (classe du jeu de données et premières lignes du tableau) :

Simple feature collection with 1200 features and 50 fields
Attribute-geometry relationships: constant (50)
Geometry type: POINT
Dimension:     XY
Bounding box:  xmin: -97.493972 ymin: 28.5833 xmax: 25.06285 ymax: 56.62525
Geodetic CRS:  WGS 84
# A tibble: 1,200 × 51
     gbifID datasetKey occurrenceID kingdom phylum class order family genus species infraspecificEpithet
 *  <int64> <chr>      <chr>        <chr>   <chr>  <chr> <chr> <chr>  <chr> <chr>   <lgl>               
 1     3.e9 5f06e39d-… "USFS - New… Plantae Trach… Magn… Faga… Jugla… Carya Carya … NA                  
 2     3.e9 5f06e39d-… "USFS - New… Plantae Trach… Magn… Faga… Jugla… Carya Carya … NA                  
 3     3.e9 5f06e39d-… "USFS - New… Plantae Trach… Magn… Faga… Jugla… Carya Carya … NA                  
 4     3.e9 5f06e39d-… "USFS - New… Plantae Trach… Magn… Faga… Jugla… Carya Carya … NA                  
 5     3.e9 5f06e39d-… "USFS - New… Plantae Trach… Magn… Faga… Jugla… Carya Carya … NA                  
 6     3.e9 5f06e39d-… "USFS - New… Plantae Trach… Magn… Faga… Jugla… Carya Carya … NA                  
 7     9 e8 0096dfc0-… "http://bio… Plantae Trach… Magn… Faga… Jugla… Carya Carya … NA                  
 8     9 e8 0096dfc0-… "http://bio… Plantae Trach… Magn… Faga… Jugla… Carya Carya … NA                  
 9     9 e8 0096dfc0-… "http://bio… Plantae Trach… Magn… Faga… Jugla… Carya Carya … NA                  
10     6 e8 5288946d-… ""           Plantae Trach… Magn… Faga… Jugla… Carya Carya … NA                  
# ℹ 1,190 more rows
# ℹ 40 more variables: taxonRank <chr>, scientificName <chr>, verbatimScientificName <chr>,
#   verbatimScientificNameAuthorship <chr>, countryCode <chr>, locality <chr>, stateProvince <chr>,
#   occurrenceStatus <chr>, individualCount <int>, publishingOrgKey <chr>, decimalLatitude <dbl>,
#   decimalLongitude <dbl>, coordinateUncertaintyInMeters <dbl>, coordinatePrecision <lgl>,
#   elevation <dbl>, elevationAccuracy <dbl>, depth <lgl>, depthAccuracy <lgl>, eventDate <dttm>,
#   day <int>, month <int>, year <int>, taxonKey <int>, speciesKey <int>, basisOfRecord <chr>, …

Il y a 1 200 occurrences dans le jeu de données. On les affiche sur la carte du monde :

Figure 241.1: Occurrences de Carya alba dans le monde.

241.1.1 Données par région

On évalue la proportion d’occurrences dans chaque région, en utilisant les 3 masques créés précédemment. Si on a au moins 50 % des occurrences dans une région, on peut continuer en travaillant uniquement sur ces données. Sinon, on vérifie qu’au moins 67 % des données tombent dans l’ensemble des régions, et on prend la région la plus représentée. Au final, s’il s’agit d’une espèce endémique d’Europe, on n’a pas besoin de manipulation supplémentaire.

[1] 0.003333333333

[1] 0.9966666667

[1] 0

Espèce endémique d’Amérique du Nord

Figure 241.2: Occurrence de Carya alba dans la région d’endémisme.

241.1.2 Licences

On s’intéresse ici au problème particulier des licences :

   CC_BY_4_0 CC_BY_NC_4_0      CC0_1_0 
         268          751          177 

[1] 37.20735786

Figure 241.3: Occurrence de Carya alba dans la région d’endémisme, selon la licence : CC BY-NC en bleu ; CC0 et CC BY en orange.

Idéalement, on aimerait avoir au moins 50 % de données vraiment libres d’utilisation (c’est-à-dire sans la clause -NC). On continue en supprimant les données en CC BY-NC.

Moins de 50 % de données librement utilisables

[1] 445

Moins de 500 occurrences utilisables